AG Glycomik & Glykobiologie

Forschungsbereiche und –ziele der AG

Glykomik, die systematische strukturelle und funktionelle Analyse von Glykanen in biologischen Systemen, ist eine ergänzende Disziplin zu Genomik, Proteomik und Metabolomik. Glykane haben grundlegende Funktionen in biologischen Systemen, z. B. in der Zell-Zell-Kommunikation, der Signaltransduktion, der Zelldifferenzierung, der Entwicklung und der Immunantwort sowie bei der Modulation von Proteinstruktur und -funktion. Aus diesem Grund spielt die Glykomik eine Schlüsselrolle beim Verständnis, der Entschlüsselung und der Überwachung biologischer Prozesse.

  • Wir entwickeln neue Methoden zur Analyse von N-, O-Glykanen und Glykosaminoglykanen aus menschlichem Blutserum, Zellen oder Geweben
  • Wir charakterisieren systematisch Glykane und Glykosaminoglykane im Zusammenhang mit Gesundheit und Krankheit (sowohl angeborene als auch Erworbene oder vererbte seltene Krankheiten)
  • Wir führen translationale Biomarkerforschung durch, um die personalisierte Medizin zu verbessern

Mitglieder

  • Prof. Dr. rer. nat. Véronique Blanchard, Professorin für Biochemie
  • Dr. rer. nat.  Karina Biskup, Wissenschaftliche Mitarbeiterin
  • MSc. Lynn Krüger, Wissenschaftliche Mitarbeiterin
  • Dr. rer. nat. Maximilian Knies, Wissenschaftlicher Mitarbeiter

Aktuelle Projekte

MSTARS (Multimodale klinische Massenspektrometrie für die Untersuchung von Therapiereistenz)

  • Charité Universitätsmedizin; gefördert durch das BMBF
  • Projektbeteiligte: Prof. Dr. Véronique Blanchard, Charité-Universitätsmedizin Berlin Institut für Laboratoriumsmedizin, Klinische Chemie und Pathobiochemie

SFB-1340 (Matrix-in-Vision) 

  • Charité Universitätsmedizin; gefördert durch die DFG bis 30.06.2022
  • Projektbeteiligte: Prof. Dr. Véronique Blanchard, Charité-Universitätsmedizin Berlin Institut für Laboratoriumsmedizin, Klinische Chemie und Pathobiochemie

Glycan-based biomarkers for the diagnostics of Alzheimer´s disease 

  • Charité Universitätsmedizin; gefördert durch die DFG 
  • Projektbeteiligte: Prof. Dr. Véronique Blanchard, Charité-Universitätsmedizin Berlin Institut für Laboratoriumsmedizin, Klinische Chemie und Pathobiochemie

Kooperationspartner:innen

  • Dr. Mujib Ullah, Department of Biology, Stanford University, USA
  • Prof. Dr. Amayo, Institute of Pathology, University of Nairobi, Kenya
  • Prof. Dr. C. Hübner, Institut für Humangenetik, Universitätsklinikum Jena (GRK 2155 “ProMoAge”) https://www.medizin.uni-halle.de/forschung/forschungsverbuende/grk-2155-promoage-proteinmodifikationen-schluesselmechanismen-des-alterns
  • Prof. Dr. Kasper-Virchow Gastrointestinale Onkologie, Universitätsklinikum Essen
  • Dr. Klein, BIH Center for Regenerative Therapies, Charité – Universitätsmedizin Berlin, Berlin
  • Prof. Dr. Sehouli, Klinik für Gynäkologie mit Zentrum für onkologische Chirurgie, Charité-Universitätsmedizin, Berlin
  • Prof. Dr. Keilholz, Charité Comprehensive Cancer Center Charité-Universitätsmedizin 
  • Prof. Dr. M. Taupitz, Klinik für Radiologie, Charité-Universitätsmedizin, Berlin (SFB 1340)
  • SFB 1340 – Matrix in Vision (Charité Universitätsmedizin): https://sfb1340.charite.de
  • Prof. Dr. Ehlers, Institute for Systemic Inflammation Research, Universität zu Lübeck
  • Prof. Dr. Blois, Klinik und Poliklinik für Geburtshilfe und Pränatalmedizin, Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf, Hamburg 
  • Prof. Dr. Reis, Institute of Molecular Pathology and Immunology, University of Porto, Portugal
  • Prof. Dr. Stintzing, Charité-Universitätsmedizin, Clinic with focus on Hematology, Oncology and Tumor Immunology
  • Prof. Dr. Infante-Duarte, Charité-Universitätsmedizin, Institute of Medical Immunology
  • Prof. Dr. Ludwig, Charité-Universitätsmedizin, Clinic for Cardiology und Angiology 
  • Prof. Dr. Poddubnyy, Charité-Universitätsmedizin, Medical Clinic for Gastroenterology, Infectiology and Rheumatology
  • Prof. Dr. Peters, Charité-Universitätsmedizin, Clinic of Psychatry and Psychotherapy
  • Prof. Dr. Ralser, Charité-Universitätsmedizin, Institute of Biochemistry

Zentrale Publikationen

Bartsch Y, Rahmöller J, Mertes MMM, Eiglmeier S, Lorenz F, Stoehr A, Braumann D, Lorenz L, Winkler A, Lilienthal GM, Petry J, Hobusch J, Steinhaus M, Hess C, Holecska V, Schoen CT, Oefner C, Leliavski A, Blanchard V and Ehlers M (2018) Sialylated autoantigen-reactive IgG antibodies attenuate disease development in autoimmune mouse models of lupus nephritis and rheumatoid arthritis. Front Immunol, 9:1183.

Dědová T, Grunow D, Kappert K, Flach D, Tauber R and Blanchard V (2018) The effect of blood sampling and preanalytical processing on human N-glycome. Plos One, 13(7):e0200507.

Nietzold C, Dietrich PM, Holzweber M, Lippitza A, Kamalakumar A,  Blanchard V, Ivanov-Pankov S, Weigel W, Pannea U, Unger WES (2018) Surface chemical characterization of model glycan surfaces and shelf-life studies of glycan microarrays using XPS, NEXAFS spectroscopy, ToF-SIMS and fluorescence scanning. Appl Surf Sci, 459:860-873.

Dědová T, Braicu EI, Sehouli J and Blanchard V (2019) Sialic acid linkage analysis refines the diagnosis of ovarian cancer. Front Oncol, 9:261.

Zhang R, Neu TR, Li Q, Blanchard V, Zhang Y and Sand W (2019) Insight into interactions of thermoacidophilic archaea with elemental sulfur: biofilm dynamics and EPS analysis. Front Microbiol, 10:896.

Wieczorek M, Braicu EI, Oliveira-Ferrer L, Sehouli J and Blanchard V (2020) Immunoglobulin G subclass-specific glycosylation changes in primary epithelial ovarian cancer. Front Immunol 11:654. 

Bartsch YC, Eschweiler S, Leliavski A, Lunding HB, Wagt S, Petry J, Lilienthal GM, Rahmöller J, de Haan N, Hölscher A, Erapaneedi R, Giannou AD, Aly L, Sato R, de Neef LA, Winkler A, Braumann D, Hobusch J, Kuhnigk K, Krémer V, Steinhaus M, Blanchard V, Gemoll T, Habermann JK, Collin M, Salinas G, Manz RA, Fukuyama H, Korn T, Waisman A, Yogev N, Huber S, Rabe B, Rose-John S, Busch H, Berberich-Siebelt F, Hölscher C, Wuhrer M, and Ehlers M (2020) IgG Fc sialylation is regulated during the germinal center reaction upon immunization with different adjuvants. J. Allergy Clin. Immunol., 146(3):652-666.e11.

Biskup K*, Blanchard V*, Castillo-Binder P, Alexander H, Engeland K and Schug S (2020) N- And O-glycosylation patterns and functional testing of CGB7 versus CGB3/5/8 variants of the human chorionic gonadotropin (hCG) beta subunit. Glycoconj. J., 37(5):599-610.

Biskup K, Stellmach C, Braicu EI, Sehouli J, Tauber R and Blanchard V (2021) Chondroitin sulfate disaccharides, a serum marker for primary serous epithelial ovarian cancer. Diagnostics, 11(7): 1143.

Franzka P, Henze H, Jung MJ, Schüler S, Mittag S, Biskup K, Liebmann L,  Kentache T, Morales J, Martínez B, Katona I, Herrmann T, AK Huebner, JC Hennings, Groth S, Gresing L, Horstkorte R, Marquardt T, Weis J, 
Kaether C, Mutchinick O, Ori A, Huber O, Blanchard V, von Maltzahn J, Huebner CA (2021) GMPPA defects cause a neuromuscular disorder with α-dystroglycan hyperglycosylation. JCI, 131(9)e139076.

Blois SM, Dveksler G, Vasta GR, Freitag N, Blanchard V, Barrientos G (2019) Pregnancy Galectinology: Insights into a Complex Network of Glycan Binding Proteins. Front Immunol, 10:1166.

Franzka P, Krüger L, Schurig MK, Olecka M, Hoffmann S, Blanchard V, Hübner CA (2021) Altered glycosylation in the ageing heart. Front. Mol. Biosc., 8:673044.

Grzeski M, Tauber E, Braicu EI, Sehouli J, Blanchard V*, Klein O* (2022) In-situ N-glycosylation signatures of epithelial ovarian cancer tissue as defined by MALDI Mass Spectrometry Imaging. Cancers, 14(4):1021.

Schwedler C, Wieczorek M, Kappert K, Heymann G, Hoppe B, Blanchard V (2022) Impact of age on anti-spike IgG glycosylation during COVID-19 infection. Front. Microbiol,13:775186

Krüger L, Biskup K, Karampelas V, Ludwig A, Poller W, Blanchard V (2022) Straightforward analysis of sulfated glycosaminoglycans by MALDI-TOF mass spectrometry from biological samples. Biology, 11(4):506.

Institutskoordinator:in

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